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載體構(gòu)建
載體構(gòu)建(vectorconstruction):載體構(gòu)建是分子生物學(xué)研究常用的手段之一。主要包括已有載體多克隆位點(MCS)的改造和已有載體啟動子、增強子、篩選標記等功能元件的改造。是為把DNA分子運送到受體細胞中去,必須尋找一種能進入細胞、在裝載了外來的DNA片段后仍能照樣復(fù)制的運載體。理想的運載體是質(zhì)粒(plasmid),在基因工程中,常用人工構(gòu)建的質(zhì)粒作為載體。載體構(gòu)建即是構(gòu)建含外源DNA的質(zhì)粒。
特點:當給質(zhì)粒插入一段外源DNA片段后,它依然能夠進行自我復(fù)制。
多克隆位點
多克隆位點(multiple cloning site, MCS),指的是包含數(shù)個(最多20個)限制性酶切位點(restriction site)的一段很短的DNA序列。也稱為多位點接頭(polylinker),是基因工程中常用到的載體質(zhì)粒的標準配置序列。MCS上含有多個單一酶切位點,是外源DNA的插入部位,每個限制性酶切位點通常是唯一的,即它們在一個特定的載體質(zhì)粒中只出現(xiàn)一次。不同酶的酶切位點可有重疊。單一酶切位點就是只有一種特定的酶能夠識別并進行酶切的位點,多克隆位點一般是位于質(zhì)粒上的一段序列,這段序列含有很多個酶切位點,但這些酶切位點每一個都被一種酶識別并酶切。
質(zhì)粒構(gòu)建
(1)質(zhì)粒構(gòu)建原理
質(zhì)粒構(gòu)建是分子生物學(xué)研究中最常用的實驗技術(shù)。原理依賴于限制性核酸內(nèi)切酶,DNA連接酶和其他修飾酶的作用,分別對目的基因和載體DNA進行適當切割和修飾后,將二者連接在一起,再導(dǎo)入宿主細胞,實現(xiàn)目的基因在宿主細胞內(nèi)的正確表達。
(2)質(zhì)粒構(gòu)建方式
質(zhì)粒構(gòu)建方式多樣,常規(guī)的T4連接酶,下面就介紹下T4連接酶構(gòu)建質(zhì)粒方法,T4連接酶可用于平末端也可用于粘性末端連接,但一般推薦適用黏性末端。
(3)質(zhì)粒載體的制備
質(zhì)粒載體的制備既可以選擇單酶切也可以選擇雙酶切,一般推薦使用雙酶切。其實目的就只有一個,盡量使載體的末端具有特異性,防止自連。
圖 質(zhì)粒圖譜
一般目的基因用于克隆表達的情況下,酶切位點的選擇要考慮到:
(1)選擇質(zhì)粒上兩個酶切位點的距離不應(yīng)小于太?。?/span>>10bp),否則影響限制性內(nèi)切酶對切點的識別,不利于空載體的雙酶切。
(2)一般目的基因用于克隆表達的情況下,酶切位點的選擇要考慮到:
目的基因片段內(nèi)部不含有所選的酶切位點(不然鑒定陽性重組子雙酶切時會將目的基因切斷)。
(3)實驗后繼應(yīng)用的所有載體(真核、原核、酵母、昆蟲)都盡可能含有所選的酶切位點。并且要保證在載體上的插入方向正確(定向克?。#ú蝗粨Q載體表達時,還要重新設(shè)計引物,以引進新的酶切位點)。
(4)盡可能選比較常用的酶切位點(常用切點酶的價格比較便宜)。
(5)兩個酶切點至少隔上3個堿基。
(6)兩個酶切點最好不要是同尾酶(切下來的殘基不要互補),否則效果相當于單酶切。
(7)最好使用酶切效率高的酶。
(8)最好使用雙酶切有共同buffer的酶。
注:質(zhì)粒構(gòu)建完成后可利用PCR原理進行測序驗證。
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