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一、檢測原理
全基因合成miR潛在結(jié)合位點(diǎn)上下游~500bp(LncRNA、circRNA或mRNA的3’UTR)野生形式WT及結(jié)合位點(diǎn)的突變形式Mut,克隆到psiCHECK-2多克隆位點(diǎn)處(1640-1674)(圖1),然后與miR的mimics/NC共同轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞測定熒光素酶讀值即可。
二、載體構(gòu)建與Mimics合成
1、構(gòu)建WT miR潛在結(jié)合位點(diǎn)到psiCHECK-2載體,命名為WT;
2、構(gòu)建Mut miR潛在結(jié)合位點(diǎn)到psiCHECK-2載體,命名為Mut(突變模式:A/T與G/C互變);
3、合成待測miR的Mimmics及陰性對照NC。
三、 實(shí)驗(yàn)分組信息
|
|
psiCHECK- Target 序列 |
miR |
Target-1 |
1 |
WT |
NC |
2 |
WT |
Mimics |
|
3 |
Mut |
NC |
|
4 |
Mut |
Mimics |
|
Target-2 |
1 |
WT |
NC |
2 |
WT |
Mimics |
|
3 |
Mut |
NC |
|
4 |
Mut |
Mimics |
四、具體實(shí)驗(yàn)步驟:
(一) 細(xì)胞轉(zhuǎn)染操作步驟
1、事先準(zhǔn)備好用于轉(zhuǎn)染的分到96孔板中的293T 細(xì)胞和目的質(zhì)粒,待細(xì)胞密度達(dá)到50%-70%為宜。
2、將10 ml DMEM與0.16 mg的lncRNA (circRNA/3’UTR)/Mut目的質(zhì)粒以及5 pmol的miR/Negative.Control(N.C)Mimics充分混勻后室溫放置(溶液A);然后將10 ml DMEM與0.3 ml 的轉(zhuǎn)染試劑(轉(zhuǎn)染試劑為漢恒生物產(chǎn)品LipoFiter,濃度為0.8 mg/ml)充分混勻(溶液B),室溫放置5 min。
3、將溶液A與溶液B充分混勻,室溫放置20 min。
4、轉(zhuǎn)染前為細(xì)胞換取新鮮培養(yǎng)基,之后將轉(zhuǎn)染混合物加入混勻。37℃,5% CO2培養(yǎng)。
5、轉(zhuǎn)染6 h后換取新鮮培養(yǎng)基,轉(zhuǎn)染48 h后收集細(xì)胞檢測。
(二) 檢測實(shí)驗(yàn)操作步驟
檢測試劑盒:Promega Dual-Luciferase system
1、將5′PLB (Passive Lysis Buffer)用蒸餾水稀釋至1′PLB,以96孔板每孔100 ml的量加入,用移液槍吹打打散細(xì)胞,置于室溫?fù)u床上緩慢搖15分鐘后,將細(xì)胞裂解液吸至1.5 ml離心管,4度12000 rpm (13200g)離心10 min,取上清移入新的管子;
2、96孔板中加入Luciferase Assay Reagent II (LAR II)( Luciferase Assay Reagent, Progema)工作液100 ml;
3、加入20 ml細(xì)胞裂解液,移液槍吹打混勻2-3次,測定記錄Firefly luciferase值,此值為內(nèi)參值。
4、加入100 ml Stop & Glo? Reagent(Luciferase Assay Reagent, Progema),移液槍吹打混勻2-3次,測定記錄Renilla luciferase值,此即為報(bào)告基因發(fā)光值。
五、 預(yù)期實(shí)驗(yàn)結(jié)果
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標(biāo)書基金實(shí)驗(yàn)咨詢 表觀遺傳組學(xué)分析
課題實(shí)驗(yàn)結(jié)題指導(dǎo) 細(xì)胞分子功能驗(yàn)證
實(shí)驗(yàn)培訓(xùn)文章潤色 動物模型裸鼠成瘤
臨床檢測科研轉(zhuǎn)化 病理染色分子互作