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真核轉錄組測序

來源:萬物生物   發(fā)布時間:2021-11-02

真核轉錄組測序

主要針對轉錄產物mRNA進行高通量測序,可快速獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的基因表達量及結構變異等,可用于差異表達分析、挖掘功能基因、RNA編輯分析等。目前已廣泛應用于生物學研究、農業(yè)、醫(yī)學等多個領域,揭示生物生長發(fā)育調控機制、不同環(huán)境適應機制、作物優(yōu)良形成機理、疾病發(fā)生發(fā)展的分子機理等。

 

應用領域:

樣本全轉錄本信息獲取

基因注釋及篩選

基因結構分析

 

產品優(yōu)勢:

準確的數字化信號,專業(yè)的檢測通量,廣泛的檢測范圍

富涵7大功能注釋數據庫,準確描述基因功能

建立差異表達分析,有效挖掘功能基因

專業(yè)的定制化信息分析服務

 

標準信息分析

1.測序數據及其質量控制

2.轉錄組測序數據組裝

3.轉錄組文庫質量評估

4. Unigene功能注釋

5.基因結構分析:CDS預測、SSR分析、SNP分析

6.基因表達量分析:Unigene表達量計算、不同樣品總體表達量比對

7.差異表達分析: 重復相關性評估、差異表達基因篩選、差異表達基因聚類分析

8.差異表達基因功能注釋和富集分析:差異表達基因GO功能富集、差異表達基因COG分類、差異表達基因KEGG注釋、差異表達基因KEGG通路富集分析

 

樣品要求:

1.樣品類型:總RNA;

2.樣品濃度:≥250 ng/ul;

3.樣品總量:>6ug(真核生物);>10ug(原核生物)

4.樣品純度: OD260/2801.8~2.2,OD260/2301.0,260nm處有正常峰值。

5.RNA完整性: 電泳檢測28S/18S1.5。(距送樣日最近的電泳結果)


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標書基金實驗咨詢       表觀遺傳組學分析

課題實驗結題指導       細胞分子功能驗證

實驗培訓文章潤色       動物模型裸鼠成瘤

臨床檢測科研轉化       病理染色分子互作


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